Examinando por Materia "Gene expression"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis comparativo de la expresión de biomarcadores asociados con la respuesta a la inmunoterapia PD-1/PD-l1 usando herramientas bioinformáticas
    (Universidad EIA, 2025) Parra Díaz, Sara; Castaño Portilla, Carolina
    RESUMEN: En el presente estudio se realizó un análisis comparativo de la expresión génica de biomarcadores asociados a la inmunoterapia dirigida a PD-1 y PD-L1 en tejidos sanos y cancerosos, con el fin de evaluar su especificidad y utilidad clínica. Se utilizaron datos de secuenciación de ARN (RNA-seq) obtenidos de bases de datos públicas, los cuales fueron procesados mediante herramientas bioinformáticas como Cutadapt, STAR, featureCounts y DESeq2. A partir del análisis de expresión diferencial, se identificaron múltiples genes con diferencias significativas en su expresión entre los grupos estudiados: sanos, cáncer, respondedores y no respondedores. Posteriormente, se realizó un análisis de enriquecimiento funcional (GSEA) con base en los resultados del análisis diferencial, revelando rutas biológicas relevantes, como la cascada del complemento y la coagulación, así como procesos relacionados con la regulación inmune y el metabolismo celular. Los resultados demostraron que ciertos genes, como DPYSL5, SFTPC, PAPLN y CXCL9, presentan diferencias significativas entre pacientes que responden o no a la inmunoterapia, lo que sugiere su posible valor como biomarcadores predictivos. Además, el uso combinado de pruebas estadísticas (Kruskal-Wallis y Mann Whitney U) permitió validar la consistencia de la expresión diferencial observada. En conjunto, estos hallazgos respaldan la utilidad de los enfoques bioinformáticos para la identificación de biomarcadores específicos, y contribuyen al desarrollo de herramientas que permitan personalizar las estrategias terapéuticas en oncología.