Examinando por Materia "Biomarkers"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis comparativo de la expresión de biomarcadores asociados con la respuesta a la inmunoterapia PD-1/PD-l1 usando herramientas bioinformáticas
    (Universidad EIA, 2025) Parra Díaz, Sara; Castaño Portilla, Carolina
    RESUMEN: En el presente estudio se realizó un análisis comparativo de la expresión génica de biomarcadores asociados a la inmunoterapia dirigida a PD-1 y PD-L1 en tejidos sanos y cancerosos, con el fin de evaluar su especificidad y utilidad clínica. Se utilizaron datos de secuenciación de ARN (RNA-seq) obtenidos de bases de datos públicas, los cuales fueron procesados mediante herramientas bioinformáticas como Cutadapt, STAR, featureCounts y DESeq2. A partir del análisis de expresión diferencial, se identificaron múltiples genes con diferencias significativas en su expresión entre los grupos estudiados: sanos, cáncer, respondedores y no respondedores. Posteriormente, se realizó un análisis de enriquecimiento funcional (GSEA) con base en los resultados del análisis diferencial, revelando rutas biológicas relevantes, como la cascada del complemento y la coagulación, así como procesos relacionados con la regulación inmune y el metabolismo celular. Los resultados demostraron que ciertos genes, como DPYSL5, SFTPC, PAPLN y CXCL9, presentan diferencias significativas entre pacientes que responden o no a la inmunoterapia, lo que sugiere su posible valor como biomarcadores predictivos. Además, el uso combinado de pruebas estadísticas (Kruskal-Wallis y Mann Whitney U) permitió validar la consistencia de la expresión diferencial observada. En conjunto, estos hallazgos respaldan la utilidad de los enfoques bioinformáticos para la identificación de biomarcadores específicos, y contribuyen al desarrollo de herramientas que permitan personalizar las estrategias terapéuticas en oncología.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Evaluación de las proteínas GRP75 y HSP71 como biomarcadores de la enfermedad de Alzheimer.
    (Universidad EIA, 2011) Castellanos Restrepo, Juliana; Valencia Duarte, Ana Victoria
    RESUMEN: La enfermedad de Alzheimer (EA) es el más común de los trastornos neurodegenerativos en la vejez y afecta a millones de personas alrededor del mundo. A pesar de los incalculables esfuerzos encaminados a explicar su etiología, actualmente, no se conoce la causa de las formas familiares de la enfermedad, que solo responden por el 5% de los casos totales, no existe un tratamiento que prevenga o retrase su aparición, más aún, su diagnóstico certero solo es posible post-mortem. La EA como otros trastornos neurodegenerativos se caracterizan por el mal plegamiento de algunas proteínas en el cerebro. Se cree que este proceso y el daño cerebral asociado, se inician varios años antes de la neurodegeneración substancial que acompaña la demencia. Este proyecto hace un análisis de la expresión de dos de los posibles blancos de diagnostico preclínico: Las proteínas GRP75 y Hsp71, siendo la primera asociada a la disfunción mitocondrial. El análisis se realizó a partir del suero de pacientes con EA y sus controles pareados por edad y sexo identificando si existen diferencias en los niveles de expresión de las dos proteínas de interés, para contribuir así al posible análisis mínimamente invasivo y a la implementación de tratamientos futuros. Utilizando la técnica de Western blot y realizando un análisis cuantitativo para obtener el nivel de expresión de las proteínas, se observó que GRP75 y HSP71 tuvieron expresión tanto en casos con enfermedad de Alzheimer como en controles y no hubo diferencias significativas entre los casos y los controles No obtuvimos evidencias para la expresión diferencial de las proteínas GRP75 ni HSP71 en los casos con (EA), sin embargo, es necesario validar los resultados, para evaluar la consistencia entre experimentos y utilizar un método como el Western blot bidimensional para evaluar la expresión diferencial de las diferentes isoformas de las proteínas entre los casos y los controles.